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Mikroorganismen und Insekten sind die beiden erfolgreichsten Organismengruppen der Erde. Die allgegenwärtigen Mikroben sind auch im Körper der Insekten in enger Verbindung vorhanden und werden als Endosymbionten bezeichnet. Von den verschiedenen Endosymbionten, die in Insekten vorkommen, erfüllen Bakterien die vielfältigsten Aufgaben. Nur weniger als ein Prozent der Endosymbionten von Insekten sind kultivierbar, und Sequenzierungstechniken der nächsten Generation wie Illumina, Ion Torrent, Roche 454 Pyrosequenzierung usw. können zum Nachweis von nicht kultivierbaren Arten eingesetzt werden.