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B. thuringiensis es una bacteria grampositiva del suelo, y produce un cuerpo de inclusión cristalino durante la esporulación. Este cuerpo parasporal está compuesto por proteínas denominadas "delta-endotoxina", y es específicamente tóxico para los insectos. Además, B. thuringiensis produce otras toxinas: alfa-toxina, beta-exotoxina y gamma-exotoxina. Es posible que no todas las sustancias tóxicas estén presentes en la bacteria. La mayoría de las cepas de B. thuringiensis producen cristales de delta-endotoxina tóxicos para los insectos lepidópteros como la polilla. Recientemente, sin embargo, varias investigaciones han demostrado que B. thuringiensis también está ampliamente distribuida en suelos naturales de diversas zonas. que B. thuringiensis constituía menos del 0,5% de más de 46.000 aislados bacterianos recuperados en diversos suelos de Estados Unidos. De los 50 aislados de Bacillus sp. del suelo de Kalimantan del Sur. Indonesia, sólo uno (2%) se identificó como B. thuringiensis basándose en el examen con microscopio de contraste de fase para detectar la presencia de cuerpos de inclusión parasporales.