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Los perros infectados con babesiosis tienen evidencia de daño renal agudo y disfunción cardíaca. El daño renal se caracteriza por la presencia de células tubulares renales, proteinuria, y enzimuria y azotaemia variables. Las causas del daño renal se atribuyen a una combinación de reducción de la tasa de filtración glomerular, hipoxia anémica y metahemoglobina. También es más probable que la hemodinámica renal sea anormal cuando existe una disfunción cardíaca, que en la babesiosis parece estar asociada con el infarto de miocardio. La disfunción cardíaca puede demostrarse mediante troponinas cardíacas séricas elevadas, histopatología cardíaca y cambios en el ECG.