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Foi realizada uma investigação para distinguir as diferenças entre 11 pais e os seus 55 cruzamentos de mostarda indiana (Brassica juncea L. ) com base no perfil proteico das sementes armazenadas utilizando SDS - PAGE no laboratório Central, S.K.N. College of Agriculture, Jobner.A SDS-PAGE foi realizada nas amostras de proteínas extraídas de cotilédones das sementes, que representavam proteínas solúveis em ácido (Tris-HCl) juntamente com gorduras e óleo. Com base nos resultados da SDS-PAGE sobre proteínas de armazenamento de sementes no presente estudo sobre mostarda indiana pode concluir-se que é desejável alargar a sua base genética através de outras abordagens como a hibridação interespecífica para futuros trabalhos de reprodução.