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Die Kokzidiose ist in der Regel eine akute Invasion und Zerstörung der Darmschleimhaut durch Protozoen der Gattungen Emeria oder Isospora. Zu den klinischen Anzeichen gehören Durchfall, Fieber, Appetitlosigkeit, Gewichtsverlust, Abmagerung und in extremen Fällen auch der Tod. Viele Infektionen sind jedoch subklinisch. Kokzidiose ist eine wirtschaftlich wichtige Erkrankung von Rindern, Schafen, Ziegen, Schweinen und Geflügel, bei der sowohl die Leber als auch der Dünndarm betroffen sein können.