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El objetivo estudio fue evaluar la contribución del uso de un simulador de prácticas de laboratorio de química en el rendimiento académico y en la motivación de los alumnos del curso Química General de la Universidad Nacional Agraria La Molina. Los participantes fueron distribuidos en forma aleatoria en dos grupos: uno de intervención y el otro de control. El software Model ChemLab versión 2.5 fue empleado por el grupo de intervención en las sesiones de práctica de laboratorio: transiciones electrónicas, enlace químico, reacciones químicas y estequiometría. El grupo de intervención logró un mejor rendimiento académico estadísticamente significativo que el grupo control en los promedios de los pasos cortos después del uso del simulador en los temas (a) transiciones electrónicas, (b) enlace químico y (c) reacciones químicas. En relación a los informes de las prácticas, el grupo de intervención también obtuvo mejor resultado en los temas (a) enlace químico y (b) estequiometría. En relación al nivel de motivación de los alumnos hacia las prácticas, el grupo de intervención presentó mayor nivel estadísticamente significativo que el grupo control, en la dimensión satisfacción.