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Lo scopo del trattamento canalare è quello di pulire il canale radicolare considerando obiettivi biologici, chimici e meccanici. I batteri sono i principali fattori causali della patologia pulpare e periapicale. Sebbene la preparazione chemio-meccanica dei canali radicolari sia in grado di ridurre il numero di batteri, la disinfezione completa del canale è difficile a causa della complessità dell'anatomia del canale radicolare. A causa della complessa anatomia del sistema canalare, una disinfezione efficace in endodonzia si ottiene solo aumentando la preparazione meccanica con irriganti antimicrobici.