Procesamiento digital de imágenes citogenéticas para su clasificación
Según la técnica de ensayo cometa para la detección de daños en el ADN.
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Se presenta el desarrollo de una herramienta bioinformática que permita detectar a través de reconocimiento de imágenes, nucleoides de ADN (con cabezas y colas) en fluorescencia, para su posterior clasificación de acuerdo con la técnica de ensayo cometa. Se busca automatizar y gestionar su almacenamiento, y optimizar los procesos en el laboratorio de citogenética. Para tal fin, se evalúan posibles métodos a aplicar y se seleccionan los que combinan algoritmos matemáticos, computacionales, redes neuronales y sistema neuro difuso. El método desarrollado realiza la detección y segmenta...
Se presenta el desarrollo de una herramienta bioinformática que permita detectar a través de reconocimiento de imágenes, nucleoides de ADN (con cabezas y colas) en fluorescencia, para su posterior clasificación de acuerdo con la técnica de ensayo cometa. Se busca automatizar y gestionar su almacenamiento, y optimizar los procesos en el laboratorio de citogenética. Para tal fin, se evalúan posibles métodos a aplicar y se seleccionan los que combinan algoritmos matemáticos, computacionales, redes neuronales y sistema neuro difuso. El método desarrollado realiza la detección y segmentación en los siguientes pasos:Se lleva a cabo un pre proceso y una segmentación inicial de la imagen en bruto. Los fragmentos obtenidos se clasifican mediante redes neuronales en tres grupos: cabeza, cola y fondo. Finalmente las cabezas o núcleos y colas se miden y son re-analizadas, clasificándolas según su relación de proporción. Este proceso de detección, segmentación y clasificación se comprobó mediante el caso de estudio con imágenes citogenéticas en ensayo cometa del Laboratorio de Citogenética General y Monitoreo Ambiental del Instituto de Biología Subtropical UNaM-IBS-CONICET.
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