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Estudo de espécies florestais nativas envolvendo análise de sementes tem merecido atenção no meio científico, por degradação dos ecossistemas brasileiros, pela qualidade fisiológica das sementes e suas potenciais aplicações. Neste sentido, o presente estudo teve como objetivo investigar e comparar os atributos morfoanatômicos, fisiológicos e bioquímicos de sementes de Parkia multijuga e Parkia pendula, sob níveis crescentes de temperatura. Foram investigadas características germinativas, morfológicas, histoquímicas e bioquímicas das sementes. As espécies apresentam padrões morfológicos distintos. Temperaturas entre 25 a 30ºC para P. pendula e 30 a 35ºC para P. multijuga, favoreceram suas características germinativas. O amido, corresponde à reserva mais estocada nos cotilédones de P. multijuga, e proteínas em cotilédones de P. pendula. As espécies apresentam concentrações distintas de açúcares solúveis totais, lipídeos totais, proteínas totais e no perfil protéico e similaridade na composição dos ácidos graxos e das proteínas. As espécies estudadas apresentam estratégias distintas na utilização das reservas orgânicas estocadas em seus cotilédones.