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As manifestações extra-intestinais da UC e do CD são muito semelhantes. Ocorrem em 30-36% dos pacientes com DII, com manifestações reumatológicas, cutâneas, oculares e hepatobiliares ocorrendo em ordem decrescente de frequência. São mais frequentes nas formas do cólon, especialmente na pancolite. Alguns se desenvolvem em paralelo com o IBD, outros independentemente. A DII associada à atividade de colite tende a ser associada no mesmo paciente. Às vezes os EIMs são os primeiros sinais do IBD e podem ser enganosos.