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Se han descrito efectos protectores de los probióticos en diversas células y tejidos. Por ejemplo, la administración de dosis adecuadas de probióticos protege el corazón de los daños, aumenta el metabolismo, modula la función del sistema inmunitario, aumenta la tasa de supervivencia, mejora el rendimiento del crecimiento, contribuye al estado de salud gastrointestinal, previene la infección de patógenos in vitro e in vivo, reduce el daño de los radicales libres y evita la progresión de los tumores.Se han sugerido diferentes vías en relación con el mecanismo de estos organismos, como la modulación de la autofagia. El papel de la autofagia es diverso en diferentes tejidos y situaciones, se ha observado la muerte celular dependiente de la autofagia en algunas células después de la sobrecarga de la autofagia, Por otra parte, se ha observado que la autofagia deteriorada condujo a algunas enfermedades como la enfermedad inflamatoria intestinal (EII), la neurodegeneración de la tuberculosis, y el envejecimiento.En este libro, intentamos revisar el mecanismo autofágico de los microbios probióticos por el que mejoran la salud, haciendo hincapié en los descubrimientos recientes en este campo.