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Embora as infecções fúngicas participem significativamente na morbilidade e mortalidade humanas, a eficácia destas doenças na saúde humana não é apreciada. O diagnóstico das infecções fúngicas é um desafio, particularmente no hospedeiro imunocomprometido. Os sinais e sintomas não são específicos, a colonização é difícil de identificar a partir de doenças invasivas, as culturas de sangue (BC) são geralmente negativas, e os doentes são frequentemente incapazes de se submeterem a procedimentos de diagnóstico invasivos. A cultura e o exame microscópico continuam a ser o "padrão de ouro", mas são insensíveis. Os ensaios de antigénio, tais como os sistemas de detecção de glucano e galactomanano, são utilizados na sua maioria. No entanto, estes testes variam em sensibilidade e especificidade, dependendo da população de doentes envolvidos. Os ensaios de base molecular ainda não são clinicamente realizados validated¿ no entanto, os avanços na tecnologia molecular mostram um grande potencial para a rápida detecção e identificação de fungos para fins médicos, científicos e comerciais. Contudo, alguns novos métodos como o MALDI-TOF MS tornaram-se o método padrão para a identificação de rotina da maioria dos organismos microbianos em laboratórios clínicos e substituíram largamente os ensaios bioquímicos.