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Está provado que o vírus da febre aftosa (FMDV) é uma doença viral altamente contagiosa, grave e economicamente devastadora em todo o mundo, que afecta animais com cascos tecidos como bovinos, veados, porcos, ovinos e caprinos. Assim, este estudo visava investigar a variação genética molecular do vírus da febre aftosa do gado bovino. Um total de vinte sequências de aminoácidos do vírus da febre aftosa do gado bovino foram recuperados do GenBank. Foram identificados vários serótipos do vírus da febre aftosa. A filogenia obtida com base nas sequências de aminoácidos do vírus da febre aftosa revelou um agrupamento diferencial entre as sequências. As estruturas proteicas 3D previstas da febre aftosa do gado alinhavam-se bem com os modelos. A informação actual sobre a biodiversidade e evolução do vírus da febre aftosa poderia ser explorada no rastreio de fontes e eventos de transmissão do vírus da febre aftosa, bem como para assegurar a cobertura vacinal do campo correspondente de extracções do vírus da febre aftosa, na maioria dos casos num país em desenvolvimento.