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Le riz (Oryza sativa) est la culture alimentaire la plus importante au monde et une source de nourriture primaire pour plus d'un tiers de la population mondiale.l'Inde est l'un des premiers centres de culture du riz. La zone de récolte du riz en Inde est la plus grande au monde. L'Inde possède une immense richesse de germoplasme de riz aromatique et de races terrestres présentant une grande variabilité en ce qui concerne leurs caractéristiques morpho-physiologiques, agronomiques, de grain et de cuisson. Les marqueurs moléculaires sont généralement classés en (i) marqueurs basés sur l'hybridation (non PCR) et (ii) marqueurs basés sur la PCR. Les marqueurs basés sur l'hybridation impliquent une digestion de restriction et l'hybridation des fragments d'ADN restreints à une sonde marquée, comme dans les RFLP et les VNTR, alors que les marqueurs basés sur la PCR impliquent l'amplification de l'ADN isolé. ). Ces marqueurs basés sur la PCR sont techniquement simples et ne nécessitent qu'une petite quantité d'ADN.