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El objetivo de este estudio fue evaluar el rendimiento, el perfil microbiológico, el perfil enzimático y la detección de cepas patógenas mediante PCR multiplex de 40 lechones (hembras y machos) en la fase de cría. El diseño experimental fue totalmente aleatorio, con cuatro tratamientos, cinco repeticiones y el sexo como factor de bloqueo. Los tratamientos se distribuyeron como sigue: T1 (control); T2 (Extracto Vegetal (VE) (500ppm)); T3 (Amoxicilina (A) (20mg kg-1) y T4 (A (20mg kg-1) + VE (500ppm)). No hubo influencia (P>0,01) entre los tratamientos sobre el peso inicial y final y la ganancia diaria de peso, pero los machos del grupo control tuvieron un consumo medio diario de pienso un 1,8% superior (P<0,01) al de los demás tratamientos. El recuento total de colonias bacterianas del grupo de control fue un 35,9%, un 70,9% y un 63,8% superior (P<0,01) al de los tratamientos con A, EV+A y EV, respectivamente. Los animales que recibieron EV o su interacción con amoxicilina mostraron genes para fimbrias y toxinas. La suplementación de EV a las dietas de los lechones destetados no determinó la ausencia de genes para la presencia de fimbrias y toxinas.