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No entanto, o nosso solo é muitas vezes esquecido - está repleto de milhares de milhões de organismos microscópicos que constituem o ambiente mais biodiverso da Terra. Tal como todos os seres vivos, também eles são afectados pelas alterações climáticas. Há um facto que é frequentemente mencionado quando se fala do solo: Há mais microorganismos numa colher de chá de solo saudável do que pessoas na Terra. A matriz de criaturas vivas que reciclam a vida vegetal e animal é incrivelmente complexa, com bactérias, protozoários, fungos, actinomicetas, nemátodos e outros a interagirem de inúmeras formas, em grande parte ainda não mapeadas. É provável que as alterações climáticas tenham impactos graves na abundância, distribuição e calendário sazonal das pragas e dos seus inimigos naturais, o que alterará o grau de sucesso dos programas de controlo biológico. As espécies de insectos fitófagos são naturalmente controladas por mecanismos descendentes (inimigos naturais) e ascendentes (disponibilidade e qualidade da planta hospedeira).