Izbytok NGS Kontig w genomah prokariot Nowyj podhod k obnaruzheniü i ustraneniü izbytochnosti w NGS Contigium pri zawershaüschej obrabotke genomow prokariot s ispol'zowaniem fil'tra Bluma i LSH
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- Russisch ausgewählt
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48,60 €
inkl. gesetzl. MwSt.,
Beschreibung
Produktdetails
Einband
Taschenbuch
Erscheinungsdatum
11.06.2020
Verlag
Sciencia ScriptsSeitenzahl
192
Maße (L/B/H)
22/15/1,2 cm
Gewicht
304 g
Sprache
Russisch
ISBN
978-620-2-57844-8
V dannoj knigi predstawlen wychislitel'nyj metod dlq obnaruzheniq i ustraneniq izbytochnyh NGS kontirowok, wnow' generiruemyh assemblerami. V ätom podhode ispol'zuütsq dwe tehniki, osnowannye na häshirowanii: fil'tr Bluma (Bloom Filter) dlq ustraneniq dubliruüschih kontegow i häsh-funkciq, chuwstwitel'naq k mestopolozheniü (LSH), dlq ustraneniq analogichnyh kontegow. Poskol'ku bol'shoe kolichestwo kontingow generiruetsq raznymi sborschikami, äti podhody trebuüt znachitel'nyh wychislitel'nyh i chelowecheskih resursow. Sokraschenie izbytochnosti oblegchaet dal'nejshij analiz dannyh i sokraschaet wremq, neobhodimoe dlq dorabotki i izlecheniq genomnyh sborok. Gibridnaq sborka nabora dannyh GAGE-B (8 bakterij, razdelennyh na 12 posledowatel'nyh assamblej w Illumina HiSeq i MiSeq) byla wypolnena s assemblerom SPAdes (De Bruijn Graph) i assemblerom Fermi (OLC). Truboprowod byl primenen k rezul'tiruüschim probkam i proizwoditel'nosti po srawneniü s drugimi analogichnymi instrumentami, takimi kak HS-BLASTN, Simplifier i CD-HIT. Predlagaemoe prilozhenie mozhet generirowat' dopolnitel'nye rezul'taty i pomogaet ob#edinit' äti rezul'taty, delaq sborku bolee tochnoj.
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