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Produktbild: Chimeric RNA
Band 2079 - 12%

Chimeric RNA Methods and Protocols

Aus der Reihe Methods in Molecular Biology
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Beschreibung

Produktdetails

Einband

Gebundene Ausgabe

Erscheinungsdatum

14.11.2019

Abbildungen

XII, 56 illus., 52 illus. in color., schwarz-weiss Illustrationen, farbige Illustrationen

Herausgeber

Hui Li + weitere

Verlag

Springer Us

Seitenzahl

262

Maße (L/B/H)

26/18,3/2,1 cm

Gewicht

700 g

Auflage

1st ed. 2020

Sprache

Englisch

ISBN

978-1-4939-9903-3

Beschreibung

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Erscheinungsdatum

14.11.2019

Abbildungen

XII, 56 illus., 52 illus. in color., schwarz-weiss Illustrationen, farbige Illustrationen

Herausgeber

Verlag

Springer Us

Seitenzahl

262

Maße (L/B/H)

26/18,3/2,1 cm

Gewicht

700 g

Auflage

1st ed. 2020

Sprache

Englisch

ISBN

978-1-4939-9903-3

Herstelleradresse

Libri GmbH
Europaallee 1
36244 Bad Hersfeld
DE

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  • Produktbild: Chimeric RNA

  • Part I: Identification and Characterization

     

    1. Prediction, Characterization, and In Silico Validation of Chimeric RNAs

                Sandeep Singh and Hui Li

     

    2. Identification of Fusion Transcripts from Unaligned RNA-Seq Reads Using ChimeRScope

                Neetha Nanoth Vellichirammal, Abrar Albahrani, You Li, and Chittibabu Guda

     

    3. Identification of Chimeric RNAs Using RNA-Seq Reads and Protein-Protein Interactions of Translated Chimeras

                Milana Frenkel-Morgenstern

     

    4. Gene Fusion Discovery with INTEGRATE

                Jin Zhang and Christopher A. Maher

     

    5. Case Study: Systematic Detection and Prioritization of Gene Fusions in Cancer by RNA-Seq: A DIY Toolkit

                Pankaj Vats, Arul M. Chinnaiyan, and Chandan Kumar-Sinha

     

    Part II: Experimental Validation

     

    6. Detection and Measurement of Chimeric RNAs by RT-PCR

                Justin Elfman and Hui Li

     

    7. Detection of Group II Intron-Generated Chimeric mRNAs in Bacterial Cells

                Félix LaRoche-Johnston, Caroline Monat, and Benoit Cousineau

     

    8. RNase Protection Assay

                Jianzhu Zhao, Jun Tang, Justin Elfman, and Hui Li

     

    9. Validation of Chimeric Fusion Peptides Using Proteomics Data

                Sandeep Singh

     

    10. NanoString nCounter Technology: High-Throughput RNA Validation

                Angela Goytain and Tony Ng

     

    Part III: Functional and Mechanistic Studies

     

    11. Knockdown of Chimeric RNA by RNAi

                Xinrui Shi, Fujun Qin, and Hui Li

     

    12. Overexpression of Chimeric RNA by Retroviral Transduction

                Hao Wu and Hui Li

     

    13. Separation of Nuclear and Cytoplasmic Fractions for Chimeric RNA Characterization

                Xinrui Shi, Fujun Qin, and Hui Li

     

    14. Confirmation of Transcriptional Read-Through Events by RT-PCR

                Xinrui Shi, Fujun Qin, and Hui Li

     

    15. Validating Gene Fusion as the Source of Chimeric RNAs

                Sachin Kumar Gupta, Jocelyn Duen-Ya Jea, and Laising Yen

     

    Part IV: Translational Applications

     

    16. Chimeric RNA and Exosomes-Based Liquid Biopsy

                Xiurong Ke, Xiao Xiong, Yusheng Lin, and Hao Zhang

     

    17. SMaRT for Therapeutic Purposes

                Lisa M. Riedmayr

     

    18. Case Study: Landscape of Chimeric RNAs in Bladder Cancer

                Dingjun Zhu and Hui Li

     

    19. Case Study: The Recurrent Fusion RNA DUS4L-BCAP29 in Non-Cancer Human Tissues and Cells

                Yue Tang, Fangxia Guan, and Hui Li