Steuerung einer Molekulardynamik Fluid-Simulation in einem verteilten System
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Die Rechenzeiten von Molekulardynamiksimulationen sind heute auch auf Höchstleistungsrechnern oft noch sehr lang. Es ist wünschenswert auch während dieser Zeit Kontrolle über den Verlauf der Berechnung zu haben. Den Schwerpunkt der Arbeit bildet die Ausbildung der Interfaces, sowie die Synchronisation und Kommunikation zwischen den einzelnen Komponenten. Hierzu ist zunächst der Prototyp einer reaktiven, multithreaded Simulationskomponente mit einer Socket-basierten Kommunikationsschnittstelle als Entwurfsmuster zu entwickeln. Die Datenübertragung kann evtl. nebenläufig zur Berechnung du...
Die Rechenzeiten von Molekulardynamiksimulationen sind heute auch auf Höchstleistungsrechnern oft noch sehr lang. Es ist wünschenswert auch während dieser Zeit Kontrolle über den Verlauf der Berechnung zu haben. Den Schwerpunkt der Arbeit bildet die Ausbildung der Interfaces, sowie die Synchronisation und Kommunikation zwischen den einzelnen Komponenten. Hierzu ist zunächst der Prototyp einer reaktiven, multithreaded Simulationskomponente mit einer Socket-basierten Kommunikationsschnittstelle als Entwurfsmuster zu entwickeln. Die Datenübertragung kann evtl. nebenläufig zur Berechnung durchgeführt werden. Zur Beschleunigung ist die Möglichkeit einer Datenkompression zu untersuchen.Die Visualisierung erfolgt auf Basis der am HLRS entwickelten COllaborative VIsualization and Simulation Environment (COVISE). Zur Molekulardynamik-Simulation wird die am IPVS/SgS im Rahmen eines Forschungsprojekts entwickelte parallele Software ls1 eingesetzt. Die Software-Architektur muss prinzipiell aber auch die Anbindung alternativer Visualisierungsumgebungen und Simlationsmodule zulassen, was exemplarisch für die Visualisierung zu zeigen ist.
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