Signature génomique de 3 écotypes d'Ostreococcus, algues Prasinophytes
Analyse de leur génome
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Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthétiques connus à ce jour. Les génomes complets de 3 écotypes d'Ostreococcus, isolés à partir de 3 niches écologiques différentes, ont été séquencés. Ces écotypes correspondent à une souche de surface adaptée à une forte luminosité, une souche profonde adaptée à une faible luminosité, et une souche de surface polyvalente à la lumière. La comparaison des génomes a révélé une divergence en acides aminés inattendue entre les gènes orthologues (70% d'identité) alors que leurs séquences 18S o...
Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthétiques connus à ce jour. Les génomes complets de 3 écotypes d'Ostreococcus, isolés à partir de 3 niches écologiques différentes, ont été séquencés. Ces écotypes correspondent à une souche de surface adaptée à une forte luminosité, une souche profonde adaptée à une faible luminosité, et une souche de surface polyvalente à la lumière. La comparaison des génomes a révélé une divergence en acides aminés inattendue entre les gènes orthologues (70% d'identité) alors que leurs séquences 18S ont une identité de 99%. La divergence entre ces 3 souches a été comparée avec les divergences de 4 lignées eucaryotes, et souligne le fait que le gène marqueur 18S sous-estime la divergence globale des organismes unicellulaires. La comparaison génomique des 3 Ostreococcus a permis d'identifier les fonctions des gènes orthologues et des gènes spécifiques. L'estimation des taux de substitution entre orthologues a permis d'identifier des gènes candidats à l'origine de l'adaptation de ces organismes à leur environnement, et suggère un rôle majeur des protéines transmembranaires dans l'évolution de ces espèces.
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