Identification moléculaire des trois espèces du complexe parapsilosis
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ALes analyses moléculaires ont révélé que C. parapsilosis sensu lato est un complexe formé de 3 espèces distinctes ; C. parapsilosis sensu stricto, de loin la plus fréquente, et 2 nouvelles espèces C. orthopsilosis et C. metapsilosis. Ces 3 espèces jumelles sont physiologiquement et morphologiquement indiscernables mais peuvent différer par leur profil de sensibilité aux antifongiques et leur pathogénicité. Actuellement, leurs distinction n'est que moléculaires. Dans ce travail, nous avons utilisé 3 techniques PCR différentes pour l'identification de ces espèces et l'estimatio...
ALes analyses moléculaires ont révélé que C. parapsilosis sensu lato est un complexe formé de 3 espèces distinctes ; C. parapsilosis sensu stricto, de loin la plus fréquente, et 2 nouvelles espèces C. orthopsilosis et C. metapsilosis. Ces 3 espèces jumelles sont physiologiquement et morphologiquement indiscernables mais peuvent différer par leur profil de sensibilité aux antifongiques et leur pathogénicité. Actuellement, leurs distinction n'est que moléculaires. Dans ce travail, nous avons utilisé 3 techniques PCR différentes pour l'identification de ces espèces et l'estimation de leur fréquence parmi 96 souches cliniques identifiées comme C. parapsilosis sensu lato. Les techniques utilisées sont: La PCR-RPSO ciblant le gène qui code la protéine ribosomale SO 40s RPSO et basée sur l'utilisation de 3 couples d'amorces spécifique chacun a une espèce, réalisant ainsi 3 tests de PCR pour chaque isolat. Dans ce travail, nous avons optimisé la technique pour utiliser les 3 couples d'amorces en PCR multiplexe. La RPFLP PCR-SADH ciblant le gène codant l'enzyme secondaire SADH. La PCR-ITS ciblant le gène 5,8s suivie d'une étape de séquençage (technique de référence).
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