Em silico identificação de micrornas e dos seus alvos em lentilha
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Neste trabalho, é adoptada a abordagem in silico para a identificação e caracterização de miRNAs conservados em etiquetas de sequência expressas em lentilha (ESTs). Para a identificação de novos miRNAs em lentilha .EST sequências foram pesquisadas para homologia contra conhecidos miRNAs maduros do reino vegetal Viridiplantae in através de BLASTN on-line. A identificação computacional baseada em comparação-genómica resultou em 12 potenciais candidatos a miRNA pertencentes a 12 famílias diferentes de miRNA em lentilha. Finalmente, utilizando os potenciais miRNA do alho, foi previ...
Neste trabalho, é adoptada a abordagem in silico para a identificação e caracterização de miRNAs conservados em etiquetas de sequência expressas em lentilha (ESTs). Para a identificação de novos miRNAs em lentilha .EST sequências foram pesquisadas para homologia contra conhecidos miRNAs maduros do reino vegetal Viridiplantae in através de BLASTN on-line. A identificação computacional baseada em comparação-genómica resultou em 12 potenciais candidatos a miRNA pertencentes a 12 famílias diferentes de miRNA em lentilha. Finalmente, utilizando os potenciais miRNA do alho, foi previsto um total de 25 genes alvo e as suas prováveis funções foram ilustradas. A maioria dos genes alvo do miRNA da lentilha que parecem codificar o crescimento, desenvolvimento, metabolismo e resposta ao stress, resistências a doenças,etc. Num futuro próximo, uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares do miRNA em lentilha pode ajudar no desenvolvimento de uma técnica nova e precisa para compreender algum mecanismo de silenciamento de genes pós-transcripcionais em resposta à tolerância ao stress.
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