Diversità genetica nelle varietà di riso popolari dell'India
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La diversità genetica di 25 varietà migliorate e di quattro varietà tradizionali è stata caratterizzata utilizzando un set di 20 coppie di primer microsatelliti polimorfici (SSR) ben scelti e polimorfici. I marcatori SSR utilizzati erano polimorfici (100,0%) e hanno generato informazioni affidabili sulla correlazione delle varietà. Gli elevati valori di polimorfismo ottenuti nella caratterizzazione sono stati attribuiti all'ipervariabilità dei marcatori microsatellitari. Tra le varietà popolari, è stata osservata la somiglianza genetica media di 0,38 che indica l'ampia diversità delle...
La diversità genetica di 25 varietà migliorate e di quattro varietà tradizionali è stata caratterizzata utilizzando un set di 20 coppie di primer microsatelliti polimorfici (SSR) ben scelti e polimorfici. I marcatori SSR utilizzati erano polimorfici (100,0%) e hanno generato informazioni affidabili sulla correlazione delle varietà. Gli elevati valori di polimorfismo ottenuti nella caratterizzazione sono stati attribuiti all'ipervariabilità dei marcatori microsatellitari. Tra le varietà popolari, è stata osservata la somiglianza genetica media di 0,38 che indica l'ampia diversità delle varietà popolari. L'analisi dei cluster basata su 87 alleli marcatori SSR ha raggruppato 29 genotipi in due grandi cluster. Il primo cluster principale comprendeva 9 genotipi di varietà tradizionali e varietà precoci migliorate. Il secondo cluster principale consisteva in 20 varietà migliorate di pedigree complesse e diversi eventi di ricombinazione. L'analisi dei componenti principali ha rivelato quattro cluster, di cui un cluster comprendeva sette genotipi provenienti dall'ecologia dei terreni poco profondi e piovosi, suggerendo che il raggruppamento era basato su tratti fisiologici. Alleli unici sono stati generati per 14 varietà, che possono essere utilizzati come tag molecolari.
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