Diversité & évolution de l'agent phytopathogène Ralstonia solanacearum
Les éctotypes du Phylotype II
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Le modèle étudié est l agent phytopathogène vasculaire Ralstonia solanacearum, d origine tellurique et très diversifié, tant au plan génétique que phénotypique. Sa classification en constante évolution témoigne d une volonté de clarifier cette biodiversité inhabituellement forte, tout en cherchant à reconnaître les écotypes structurant ce complexe d espèces. L adaptation de souches aussi diverses à un hôte donné ou pour la tolérance au froid nous a conduit à dresser un bilan de la situation R. solanacearum en Europe et, in extenso, dans le bassin méditerranéen. Notre ap...
Le modèle étudié est l agent phytopathogène vasculaire Ralstonia solanacearum, d origine tellurique et très diversifié, tant au plan génétique que phénotypique. Sa classification en constante évolution témoigne d une volonté de clarifier cette biodiversité inhabituellement forte, tout en cherchant à reconnaître les écotypes structurant ce complexe d espèces. L adaptation de souches aussi diverses à un hôte donné ou pour la tolérance au froid nous a conduit à dresser un bilan de la situation R. solanacearum en Europe et, in extenso, dans le bassin méditerranéen. Notre approche en génomique comparative nous a donné l'opportunité de décrire le premier pangénome chez cet agent pathogène et les approches bio-informatiques permettent de concevoir une refonte pertinente du complexe d espèces R. solanacearum en trois nouvelles espèces génomiques. La densité des données expérimentales accumulées par le biais d'une puce à ADN pangénomique a permis une démarche vers l écologie moléculaire, et de reconstituer certains pans du passé évolutif des principaux écotypes du phylotype II: les souches Brown Rot, Moko et émergentes.
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