Aplicação de Algoritmo genético no mapeamento de genes epistáticos
Experimental em Cruzamentos Controlados
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Este livro descreve um método geral para melhorar a eficiência computacional em mapeamento simultâneo de múltiplos QTL's e de seus efeitos de interação. A literatura tem usado métodos de busca exaustiva ou busca condicional. O Autor propõe o uso do algoritmo genético para pesquisar o espaço multilocos, sendo este mais útil para genomas maiores e mapas densos de marcadores moleculares. Por meio de estudos de simulações, o autor mostra que a busca baseada no algoritmo genético tem eficiência, em geral, mais alta que aquela de um método de busca condicional e que esta eficiência ...
Este livro descreve um método geral para melhorar a eficiência computacional em mapeamento simultâneo de múltiplos QTL's e de seus efeitos de interação. A literatura tem usado métodos de busca exaustiva ou busca condicional. O Autor propõe o uso do algoritmo genético para pesquisar o espaço multilocos, sendo este mais útil para genomas maiores e mapas densos de marcadores moleculares. Por meio de estudos de simulações, o autor mostra que a busca baseada no algoritmo genético tem eficiência, em geral, mais alta que aquela de um método de busca condicional e que esta eficiência é comparável àquela de uma busca exaustiva. Na formalização do algoritmo genético é pesquisado o comportamento de parâmetros tais como: probabilidade de recombinação, probabilidade de mutação, tamanho amostral, quantidade de gerações, quantidade de soluções e tamanho do genoma, para diferentes funções objetivo: BIC, AIC e SSE, a soma de quadrados dos resíduos de um modelo ajustado. A aplicação das metodologias propostas é também considerada na análise de um conjunto de dados genotípicos e fenotípicos de ratos provenientes de um delineamento F2.
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