Aplicación de la tecnología de microarrays
Un estudio de los perfiles de expresión génica en Aspergillus nidulans en inanición de pectina y glucosa.
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La construcción de bibliotecas de cDNA es útil para entender la expresión de genes en organismos bajo diferentes condiciones, pero la secuenciación aleatoria de cDNAs no sesgados es laboriosa y da lugar a redundancia. Nuestro objetivo es aislar los cDNAs inducidos al cambiar Aspergillus nidulans de glucosa a polisacáridos seleccionados. Hemos ideado un método de hibridación por sustracción negativa que implica el cribado de una biblioteca hecha de cDNAs de células cultivadas bajo una condición fisiológica seleccionada con sondas de cDNA etiquetadas de otra condición fisiológica. E...
La construcción de bibliotecas de cDNA es útil para entender la expresión de genes en organismos bajo diferentes condiciones, pero la secuenciación aleatoria de cDNAs no sesgados es laboriosa y da lugar a redundancia. Nuestro objetivo es aislar los cDNAs inducidos al cambiar Aspergillus nidulans de glucosa a polisacáridos seleccionados. Hemos ideado un método de hibridación por sustracción negativa que implica el cribado de una biblioteca hecha de cDNAs de células cultivadas bajo una condición fisiológica seleccionada con sondas de cDNA etiquetadas de otra condición fisiológica. En un cribado de los transcritos inducidos al cambiar la fuente de carbono, se aislaron 3.532 negativos. Se realizaron experimentos de microarrays de un solo canal para confirmar que la mayoría de los negativos eran inducidos de forma diferencial. Para comprender mejor la regulación, utilizamos microarrays para identificar los cambios en la expresión génica tras el cambio de glucosa a pectina o la inanición de glucosa. Los resultados de este estudio demuestran la utilidad de la potente tecnología de microarrays para estudiar los perfiles de expresión génica en diversas condiciones fisiológicas.
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