Análise da via metabólica em direcção ao aconselhamento da terapia genética
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A rede metabólica é uma das classes importantes de redes biológicas, consistindo em reacções enzimáticas envolvendo substratos e produtos. Os recentes desenvolvimentos nas bases de dados de vias permitem-nos analisar as redes metabólicas conhecidas. No entanto, a maioria das redes metabólicas específicas do organismo ficam com um número de reacções enzimáticas desconhecidas, ou seja, faltam muitas enzimas nas vias metabólicas conhecidas, e estas enzimas em falta são definidas como buracos nas vias metabólicas, Embora todas as reacções em algumas vias sejam conhecidas, mas tam...
A rede metabólica é uma das classes importantes de redes biológicas, consistindo em reacções enzimáticas envolvendo substratos e produtos. Os recentes desenvolvimentos nas bases de dados de vias permitem-nos analisar as redes metabólicas conhecidas. No entanto, a maioria das redes metabólicas específicas do organismo ficam com um número de reacções enzimáticas desconhecidas, ou seja, faltam muitas enzimas nas vias metabólicas conhecidas, e estas enzimas em falta são definidas como buracos nas vias metabólicas, Embora todas as reacções em algumas vias sejam conhecidas, mas também estas vias têm buracos, o buraco neste caso significa que não conhecemos os genes por detrás destas reacções. O pilar do ciclo de investigação é a recolha de dados que precede a fase de análise para resolver o buraco da via. Os dados necessários para esta área estão dispersos por diferentes fontes de dados, o que representa um problema para os investigadores desta área. Esta tese fornece uma solução para este obstáculo através da recolha dos dados necessários de várias fontes de dados numa base de dados RGBMAPS; também desenvolvemos uma ferramenta que poderia ser utilizada por outros investigadores para analisar os buracos do caminho.
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