Star Wars The Clone Wars erzählt die Geschichte der Klon-Kriege, die zwischen Episode II und III stattfanden. Dem Jedi-Ritter Anakin Skywalker wird die junge Padawan-Schülerin Ahsoka Tano zur Seite gestellt. Die Verantwortung für einen Padawan zu übernehmen, scheint bereits anstrengend genug für den selbst noch sehr jungen Jedi. Doch mit dem Auftrag, den Sohn des Hutts Jabba zu retten, werden ihr Teamgeist und ihre gemeinsame Stärke erst richtig auf die Probe gestellt. Mit von der Partie sind auch die anderen bekannten Charaktere wie Obi-Wan Kenobi, R2D2, C3PO und Meister Yoda.