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  • Produktbild: Statistical Genomics
  • Produktbild: Statistical Genomics
Band 1418 - 13%

Statistical Genomics Methods and Protocols

Aus der Reihe Methods in Molecular Biology
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101,99 € UVP 117,69 €

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Beschreibung

Produktdetails

Einband

Taschenbuch

Erscheinungsdatum

19.04.2018

Abbildungen

XI, 113 illus., 85 illus. in color., schwarz-weiss Illustrationen, farbige Illustrationen

Herausgeber

Ewy Mathé + weitere

Verlag

Springer Us

Seitenzahl

418

Maße (L/B/H)

25,4/17,8/2,4 cm

Gewicht

856 g

Auflage

Softcover reprint of the original 1st ed. 2016

Sprache

Englisch

ISBN

978-1-4939-8083-3

Beschreibung

Rezension

“This collection of articles offers a thorough overview of the field, making it an opportune and useful addition to the literature. The book is written in an accessible language and the variety of the topics which are presented recommends it as an excellent starting point or updated reference of the field. It is suitable for both post-graduate and established researchers, and the numerous examples that accompany the discussed topics recommend it as an asset.” (Irina Ioana Mohorianu, zbMATH 1346.92003, 2016)

Produktdetails

Einband

Taschenbuch

Erscheinungsdatum

19.04.2018

Abbildungen

XI, 113 illus., 85 illus. in color., schwarz-weiss Illustrationen, farbige Illustrationen

Herausgeber

Verlag

Springer Us

Seitenzahl

418

Maße (L/B/H)

25,4/17,8/2,4 cm

Gewicht

856 g

Auflage

Softcover reprint of the original 1st ed. 2016

Sprache

Englisch

ISBN

978-1-4939-8083-3

Herstelleradresse

Libri GmbH
Europaallee 1
36244 Bad Hersfeld
DE

Email: gpsr@libri.de

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  • Produktbild: Statistical Genomics
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  • Part I Groundwork

     1.   Overview of Sequence Data Formats Hongen Zhang

     2.   Integrative Exploratory Analysis of Two or More Genomic Datasets Chen Meng and Aedin Culhane       

     3.   Study Design for Sequencing Studies Loren Honaas, Naomi Altman, and Martin Krzywinski

     4.   Genomic Annotation Resources in R/Bioconductor Marc RJ Carlson, Hervé Pagès, Sonali Arora, Valerie Obenchain, and Martin Morgan

    Part II Public Genomic Data

    5.  The Gene Expression Omnibus Database Emily Clough and Tanya Barrett

    6.  A Practical Guide to the Cancer Genome Atlas (TCGA)     Zhining Wang, Mark A. Jensen, and Jean Claude Zenklusen

     

    Part III Applications

    7.    Working with Oligonucleotide Arrays Benilton S. Carvalho

    8.    Meta-Analysis in Gene Expression Studies Levi Waldron and Markus Riester

    9.    Practical Analysis of Genome Contact Interaction Experiments Mark A. Carty and Olivier Elemento

    10. Quantitative Comparison of Large-Scale DNA Enrichment Sequencing Data Matthias Lienhard and Lukas Chavez

    11. Variant Calling From Next Generation Sequence Data Nancy F. Hansen

    12. Genome-Scale Analysis of Cell-Specific Regulatory Codes Using Nuclear Enzymes Songjoon Baek and Myong-Hee Sung

    Part IV Tools

    13. NGS-QC Generator: A Quality Control System for ChIP-seq and Related Deep Sequencing-Generated Datasets Marco Antonio Mendoza-Parra, Mohamed-Ashick M. Saleem, Matthias Blum, Pierre Etienne Cholley, and Hinrich Gronemeyer

    14. Operating on Genomic Ranges Using BEDOPS Shane Neph, Alex P. Reynolds, M. Scott Kuehn, and John A. Stamatoyannopoulos

    15. GMAP and GSNAP for Genomic Sequence Alignment: Enhancements to Speed, Accuracy, and Functionality Thomas D. Wu, Jens Reeder, Michael Lawrence, Gabe Becker, and Matthew Brauer

    16. Visualizing Genomic Data using Gviz and Bioconductor Florian Hahne and Robert Ivanek

    17. Introducing Machine Learning Concepts with WEKA Tony C. Smith and Eibe Frank

    18. Experimental Design and Power Calculation for RNA-Seq Experiments Zhijin Wu and Hao Wu

    19. It’s DE-licious: A Recipe for Differential Expression Analyses of RNA-Seq Experiments Using Quasi-Likelihood Methods in EdgeR Aaron T.L. Lun, Yunshun Chen, and Gordon K. Smyth