Building Phylogenetic Trees Maximum Likelihood Methods based on Markovian Codon Models of Molecular Evolution
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Beschreibung
Produktdetails
Einband
Taschenbuch
Erscheinungsdatum
07.08.2014
Verlag
AV AkademikerverlagSeitenzahl
140
Maße (L/B/H)
22/15/0,9 cm
Gewicht
204 g
Sprache
Englisch
ISBN
978-3-639-63277-4
This book introduces Markovian codon models of evolution in maximum likelihood phylogeny inference. The literature show that codon models constitute a more realistic representation of protein-coding sequences when compared against amino acid and nucleotide models. Our results extend this by showing that codon models are also expected to outperform these two competing approaches when re-constructing phylogenetic trees. To enable this analysis, we have created a software package called CodonPhyml, which is freely available under an open source license.
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