Application de la technologie des microréseaux
Une étude du profilage de l'expression des gènes chez Aspergillus nidulans en cas de privation de pectine et de glucose.
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La construction de bibliothèques d'ADNc est utile pour comprendre l'expression des gènes dans les organismes sous différentes conditions, mais le séquençage aléatoire d'ADNc non biaisés est laborieux et donne lieu à des redondances. Nous avons cherché à isoler les ADNc induits en faisant passer Aspergillus nidulans du glucose à des polysaccharides sélectionnés. Nous avons conçu une méthode d'hybridation par soustraction négative qui consiste à cribler une bibliothèque constituée d'ADNc provenant de cellules cultivées dans une condition physiologique donnée avec des sondes ...
La construction de bibliothèques d'ADNc est utile pour comprendre l'expression des gènes dans les organismes sous différentes conditions, mais le séquençage aléatoire d'ADNc non biaisés est laborieux et donne lieu à des redondances. Nous avons cherché à isoler les ADNc induits en faisant passer Aspergillus nidulans du glucose à des polysaccharides sélectionnés. Nous avons conçu une méthode d'hybridation par soustraction négative qui consiste à cribler une bibliothèque constituée d'ADNc provenant de cellules cultivées dans une condition physiologique donnée avec des sondes d'ADNc marquées provenant d'une autre condition physiologique. Lors d'un criblage des transcrits induits par le changement de source de carbone, 3 532 négatifs ont été isolés. Des expériences de microréseau à canal unique ont été réalisées pour confirmer que la majorité des négatifs étaient effectivement induits de manière différentielle. Pour mieux comprendre la régulation, nous avons utilisé des microréseaux pour identifier les changements d'expression des gènes après le passage du glucose à la pectine ou la privation de glucose. Les résultats de cette étude montrent l'utilité de la puissante technologie des puces à ADN pour étudier le profilage de l'expression génétique dans diverses conditions physiologiques.
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