Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen,
Computer und Informatik auf der anderen - beide üben Faszination
aus, halten aber viele Interessenten auf respektvolle Distanz. Die
Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff
Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei
unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue
Einsichten geliefert.Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik
ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von
Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne
Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten
biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance
verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig -
Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach.
Hier will das neue Buch eine Lücke schließen. Die molekularen
Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer
kostenlos - man braucht nur PC und das Internet.Einführende Kapitel
in die Molekularbiologie, in Evolution, Taxonomie und Kladistik, in
Computerprogramme zur Sequenzverwaltung und für molekulare
Phylogenetik ermöglichen je nach Wissenshintergrund den schnellen
Einstieg. Wer schon etwas weiß, dem wird in einem speziellen
Kapitel der direkte Weg zum Stammbaum aufgezeigt. Und wer es genau
wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen
methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Likelihood und
natürlich auch die neuen Bayesianischen Verfahren. Alles wird
"hands on" anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit
der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen
werden kann (BioEdit, Clustal, MEGA, MrBayes, PAML, PAUP,
SplitsTree oder TreePuzzle).Das neue Buch bietet so eine ideale
Balance zwischen Theorie und Praxis, um auch wirklich zu greifbaren
Ergebnissen zu kommen. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am
Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem
Glossar und einem umfangreichen Index.
"Herrlich wie Knoop und Müller den trockenen Stoff der molekularen Phylogenetik in einfacher, unprätentiöser und humorvoller Rede pädagogisch aufbereitet haben: Viel besser kann man das nicht darstellen. (...) Ein bemerkenswertes, ein empfehlenswertes Buch." (Laborjournal, Oktober 2010)
"Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will dieses Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC, das Internet und dieses Buch." (Lebensmittel & Biotechnologie)
Herrlich wie Knoop und Müller den trockenen Stoff der molekularen Phylogenetik in einfacher, unprätentiöser und humorvoller Rede pädagogisch aufbereitet haben: Viel besser kann man das nicht darstellen. (...) Ein bemerkenswertes, ein empfehlenswertes Buch. Laborjournal, Oktober 2010 Das buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index. www.literatur-report.de, November 2008 Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will dieses Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC, das Internet und dieses Buch. Lebensmittel & Biotechnologie V. Knoop und K. Müller haben ein hervorragendes Einsteigerhandbuch mit sehr viel Engagement und didaktischem Können produziert, das alle wichtigen Themen berücksichtigt und das man gerne lesen mag. Es gibt einen kompetenten Überblick über die molekulare Systematik und Phylogenetik. Gene und Stammbäume sollte man allen ans Herz legen, die sich mit dieser wichtigen und zukunftsweisenden Materie wissenschafltich beschäftigen wollen. Physik in unserer Zeit (...) ein richtiges Arbeitsbuch, das für Studierende und jene mit Nachholbedarf in kompakten Portionen alles Wichtige bereitstellt. Es kann daher allen Interessierten empfohlen werden. Chemiereport.at
Prof. Dr. Volker Knoop (geb. 1963) hat in Berlin Biochemie studiert und dort am Institut für Genbiologische Forschung und später an der Universität Ulm gearbeitet. Er ist seit 2002 Leiter der Abteilung Molekulare Evolution an der Universität Bonn und Gründungsdirektor des dortigen IZMB, des Instituts für zelluläre und molekulare Botanik. Dr. Kai Müller (geb. 1975) ist wissenschaftlicher Assistent am Nees-Institut für Biodiversität der Pflanzen der Universität Bonn und leitet dort die Arbeitsgruppe "Systematik und Evolution". Zu seinen Forschungsschwerpunkten gehören Phylogenie und Systematik verschiedener Blütenpflanzengruppen, die Evolution von Chloroplasten-Genomen, sowie die Entwicklung bioinformatischer Methoden und Software.
1 Die Molekularen Grundlagen des Lebens 1.1 Gene und Genome, Nukleotide und DNA 1.2 Der genetische Code 1.3 Die Proteinbiosynthese 1.4 Genome in Kern, Mitochondrien und Chloroplasten 1.5 Molekulare Besonderheiten 1.6 Aus der Werkzeugkiste der Molekulargenetik 1.7 Leseempfehlungen
2 Evolution, Taxonomie und Phylogenie 2.1 Evolution 2.2 Taxonomie 2.3 Phylogenetik 2.4 Molekulare Phylogenetik 2.5 Vom Alignment zum Stammbaum 2.6 Leseempfehlungen
3 Datenbanken, Molekulare Sequenzen, Programme 3.1 Die öffentlichen Datenbanken für molekulare Sequenzdaten 3.2 Suchstrategien in Datenbanken 3.3 Sequenzverwaltung und Alignments 3.4 Integrierte Programmpakete für die phylogenetische Analyse (MEGA, PAUP , PHYLIP) 3.5 Speziellere Anwendungen in phylogenetischen Analysen 3.6 Graphische Baumdarstellungen 3.7 Anwendungen im WWW 3.8 Leseempfehlungen
4 Ein schneller Weg zum Stammbaum 4.1 Die wichtigen Software-Pakete im Vergleich 4.2 Leichter Einstieg mit MEGA 4.3 Arbeiten mit PAUP 4.4Leseempfehlungen
